药物设计与制备平台由四个要素组成：分子设计与模拟体系（主要有分子建模与动力学模拟、虚拟筛选）、结构生物学实验体系（主要评价药物分子与靶标的相互作用）、分子制备体系（主要包括分子的天然产物提取与生物/化学修饰）、高通量药物筛选与活性评价体系。实验室配备完善的实验设备：傅里叶变换近/中红外光谱仪、平行合成装置、旋光仪、多肽合成仪、落球式粘度密度测量仪、超灵敏等温滴定微量热仪、生物分子相互作用仪、高通量高内涵筛选系统、气相色谱仪、清氘交换-高清离子淌度质谱、超高效液相色谱和药物设计与生物信息机群等。